衛生局於疫情流行後依「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例（簡稱特別條例）」、秋冬防疫專案等規定，針對違反上述規定之民眾及業者分別處以罰鍰。居家檢疫攜毒趴趴走的陳姓市民其2月16日凌晨23時25分外出購買飲料小於2小時裁罰10萬元罰鍰，17日中午1時30分再次外出向友人借錢，依法擅離2~6小時裁罰20萬元罰鍰，合計裁罰30萬元罰鍰。
臺南市長黃偉哲呼籲市民「自律就是自由」，請居家隔離（檢疫）民眾、及府城頭家讀懂全球疫情(死亡人數攀升) 、保護同胞，確實配合防疫政策相關規定，切勿心存僥倖，以免觸法受重罰。違反「居家檢疫」擅離住家將依特別條例第15條第2項之規定，處新臺幣10至100萬元罰鍰；違反「居家隔離」擅離住家，將依特別條例第15條第1項之規定，處新臺幣20至100萬元罰鍰，防疫當前絶不寛貸。
衛生局許以霖局長懇切提醒居家隔離或檢疫者於隔離或檢疫期間，有問題可以撥打臺南市防疫專線06-2880180。如未配合中央流行疫情指揮中心防治措施，將依特別條例從重裁罰，請市民切勿以身試法。「嚴重特殊傳染性肺炎」相關資訊，可參閱疾管署全球資訊網(https://www.cdc.gov.tw/) 或衛生局全球資訊網網瀏覽「嚴重特殊傳染性肺炎」防治相關資訊 (https://health.tainan.gov.tw) 。
